Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms