Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrabdQ99JY4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms