Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ddb2Q99J79 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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