Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Def8Q99J78 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Def8Q99J78 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Def8Q99J78 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms