Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms