Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf144aQ925F3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf144aQ925F3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf144aQ925F3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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