Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alpk3Q924C5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Alpk3Q924C5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms