Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms