Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trub2Q91WG3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms