Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms