Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms