Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klc3Q91W40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klc3Q91W40 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms