Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd3Q91W18 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd3Q91W18 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms