Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms