Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabp4Q8VHC5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms