Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms