Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Q8VDP2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q8VDP2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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