Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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