Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn4Q8VCH8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms