Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpm8Q8R4D5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms