Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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