Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Treml1Q8K558 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml1Q8K558 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms