Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolbQ8K409 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms