Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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