Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms