Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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