Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssh3Q8K330 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssh3Q8K330 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssh3Q8K330 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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