Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms