Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc12Q8K2L8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms