Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms