Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacs1Q8K212 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms