Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms