Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ep400Q8CHI8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms