Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hpf1Q8CFE2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms