Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms