Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms