Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc9Q8CDN9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms