Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4aQ8C9S8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4aQ8C9S8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4aQ8C9S8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Atg4aQ8C9S8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Atg4aQ8C9S8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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Atg4aQ8C9S8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4aQ8C9S8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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