Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc113Q8C5T8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms