Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TiparpQ8C1B2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TiparpQ8C1B2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms