Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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