Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vps13cQ8BX70 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vps13cQ8BX70 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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