Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp5Q8BX09 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp5Q8BX09 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms