Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVC4

Ccdc68, Coiled-coil domain-containing protein 68, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc68Q8BVC4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc68Q8BVC4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc68Q8BVC4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms