Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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