Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp43Q8BUM9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp43Q8BUM9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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