Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rccd1Q8BTU7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms