Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup54Q8BTS4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms