Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pbrm1Q8BSQ9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbrm1Q8BSQ9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms