Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bnc2Q8BMQ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms